Pääjohtaja nimittää muut virkamiehet kuin kilpailuasioiden vastuualueen ylijohtajan, kuluttaja-asioiden vastuualueen ylijohtajan ja rautatiealan sääntelyelimen päällikön sekä ottaa työsopimussuhteisen henkilöstön, jollei työjärjestyksessä toisin määrätä.

Rautatiealan sääntelyelimen päällikön virkavapauden myöntää työ- ja elinkeinoministeriö. Yli kaksi vuotta kestävä virkavapauden myöntää kuitenkin valtioneuvosto, jollei virkavapaus perustu lakiin tai virkaehtosopimukseen.

Pääjohtajan sekä kilpailuasioiden vastuualueen ylijohtajan, kuluttaja-asioiden vastuualueen ylijohtajan ja rautatiealan sääntelyelimen päällikön sijaisen määrää työ- ja elinkeinoministeriö.

Generaldirektören utnämner samtliga tjänstemän förutom överdirektören för ansvarsområdet för konkurrensfrågor, överdirektören för ansvarsområdet för konsumentfrågor och chefen för regleringsorganet för järnvägssektorn samt anställer personal i arbetsavtalsförhållande, om inte något annat bestäms i arbetsordningen.

Tjänstledighet för chefen för regleringsorganet för järnvägssektorn beviljas av arbets- och näringsministeriet. Tjänstledighet som varar längre än två år och som inte grundar sig på lag eller tjänstekollektivavtal beviljas dock av statsrådet.

Ställföreträdaren för generaldirektören samt ställföreträdaren för överdirektören för ansvarsområdet för konkurrensfrågor, för överdirektören för ansvarsområdet för konsumentfrågor och för chefen för regleringsorganet för järnvägssektorn förordnas av arbets- och näringsministeriet.