För utlåtanden enligt 25 kap. 8 § i ärvdabalken tar Landsbygdsverket ut en tidsbaserad avgift 49 euro per timme.

För behandling av Flegt -licenser tas det ut en avgift på 70 euro. Om det för behandlingen av licensen finns grundad anledning att ta prov av varupartiet eller att skaffa annan motsvarande utredning för att intyga att varupartiet motsvarar de uppgifter som anges i licensen eller de uppgifter som licensmyndigheten annars har, tas av importören ut avgift som motsvarar totala kostnader som anskaffandet av utredningen gett upphov till Landsbygdsverket, för vilka avgiften bestäms enligt prestationens självkostnadsvärde.

I årlig övervakningsavgift för klassificering av slaktkroppar tas det ut en grundavgift på 2 400 euro samt en tilläggsavgift på 59 cent för slaktade och klassificerade nötkreatur och 3 cent för svin. För slakterier där det slaktas under 75 vuxna nötkreatur per vecka eller under 200 grisar per vecka som årligt genomsnitt är grundavgiften 1 200 euro. Av slakterier som huvudsakligen slaktar får tas det ut en årlig grundavgift på 800 euro. Övervakningsavgiften tas ut två gånger per år på basis av de rapporter som slakterierna skickar till Landsbygdsverket. Grundavgiften tas ut till halva beloppet vid vartdera tillfället.