Ministeriötä ja sen hallinnonalaa koskevien laajakantoisten tai muuten tärkeiden asioiden käsittelyä varten on johtoryhmä, jonka puheenjohtajana on ministeri sekä muina jäseninä kansliapäällikkö, osastopäälliköt ja viestintäjohtaja. Ministerin erityisavustajilla on oikeus olla läsnä johtoryhmän kokouksessa. Jos ministerillä on valtioneuvoston ohjesäännön 44 §:n 2 momentin mukainen valtiosihteeri, valtiosihteerillä on oikeus olla läsnä johtoryhmän kokouksessa. Jos ministeriössä on useampia ministereitä, kunkin ministerin toimialaan kuuluvia asioita varten perustetaan erillinen johtoryhmä.

Ministeriön johtoryhmän sihteerinä on kansliapäällikön määräämä virkamies.